Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SCN2BO60939 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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