Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLX3O43711 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLX3O43711 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms