Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TO15178 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TO15178 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TO15178 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms