Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms