Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms