Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NOTOA8MTQ0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms