Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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