Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC144AA2RUR9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms