Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM223A0PJW6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms