Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms