Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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