Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms