Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms