Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms