Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI4Q9UM07 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI4Q9UM07 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI4Q9UM07 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI4Q9UM07 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI4Q9UM07 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI4Q9UM07 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms