Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms