Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms