Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL28Q9NXS3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms