Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms