Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms