Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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