Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms