Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM60AQ9NP50 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM60AQ9NP50 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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