Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms