Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SMYD3Q9H7B4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMYD3Q9H7B4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMYD3Q9H7B4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMYD3Q9H7B4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMYD3Q9H7B4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMYD3Q9H7B4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMYD3Q9H7B4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMYD3Q9H7B4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms