Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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