Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms