Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms