Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms