Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms