Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNS3Q9BQ31 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KCNS3Q9BQ31 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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