Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms