Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms