Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms