Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms