Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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C2orf48Q96LS8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C2orf48Q96LS8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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