Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ACBD5-203ENST00000375901 3685 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms