Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGF29Q96ES7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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