Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKD1Q969G9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms