Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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