Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms