Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms