Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB43Q86YS6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms