Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP1Q86WV1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms