Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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