Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CCDC80Q76M96 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC80Q76M96 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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