Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms