Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms