Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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