Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms